RRBS測序

RRBS 由于經過了Bisulfite 處理,憑借著其單堿基分辨率,能夠精確評估覆蓋區域的甲基化水平。再加上酶切打斷的原理,該方法的覆蓋范圍具有良好的重復性和穩定性,并且能通過酶切位點過濾部分降解片段對結果的影響。但是RRBS 的覆蓋范圍被酶切位點所限制,只能覆蓋基因組的部分區域,主要集中在promoter 和CpG island 等富含CpG 的區域。在疾病研究中,Promoter 的甲基化狀態與基因表達、性狀表型息息相關,RRBS 作為一種關注CpG-rich 區域的甲基化研究方法,能夠避免過多的數據浪費,更有針對性的研究覆蓋區域的甲基化狀態,使得大樣本量單堿基分辨率的甲基化差異研究成為可能。綜上所述:RRBS 作為一種高性價比的甲基化研究方法,在大規模的臨床樣本的研究中具有廣泛的應用前景。

應用領域

大樣本單堿基分辨率甲基化差異分析
疾病分子標記開發

技術路線

分析內容

1. 標準信息分析
   a)去接頭污染,去低質量reads 和產量情況統計
   b)RRBS 序列與參考序列的比對(基于a)
   c)Promoter 和CpG 島(CGI)覆蓋度分析(基于a,b)
   d)Promoter 和CGI 區的甲基化分析(基于a,b)
   e)差異性甲基化區域(DMR)分析(基于a,b)
2. 高級信息分析
結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容

樣品要求

樣品類型:DNA 樣品;
樣品需求量:總量≥ 3μg,濃度≥50ng/μL;
樣品完整性:DNA 無明顯降解與蛋白污染,需提供凝膠電泳檢測膠圖

項目周期

單個樣品標準流程的運轉周期約為80 個工作日

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